PUBLICATIONS

Travaux sélectionnés et liste complète

Une sélection de travaux marquants et la liste complète des publications évaluées par les pairs sur les nanopores biologiques et artificiels, la reconnaissance moléculaire, les biomarqueurs de maladies et les applications émergentes.

28Articles évalués par les pairs
1,767+Citations Google Scholar (octobre 2026)
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PUBLICATIONS À LA UNE

Jalons scientifiques

Six articles illustrant la progression de nos travaux, du transport dans les nanopores et de la reconnaissance moléculaire jusqu’à l’analyse de biomarqueurs dans des échantillons complexes.

Résumé graphique de l’article Small sur les biomarqueurs hormonaux sulfatés et non sulfatés dans le sérum humain
Small2026

Discrimination of Sulfated and Unsulfated Gut-Hormone Biomarkers in Human Serum

Identification de la CCK-8 et de la SO₃-CCK-8 dans le sérum humain à partir de trois paramètres complémentaires mesurés par nanopore.

Sérum humainModifications post-traductionnelles
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Illustration de l’article ACS Nano sur l’ocytocine et ses variants structuraux
ACS Nano2025

Discrimination of Oxytocin and Its Structural Variants by Nanopore

Discrimination de variants structuraux de l’ocytocine à partir de signatures électriques complémentaires à l’échelle de la molécule unique.

NeuropeptidesVariants structuraux
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Résumé graphique de l’article Chemical Science sur les isomères cis/trans de la proline
Chemical Science2025

Single-Molecule Nanopore Sensing of Proline cis/trans Amide Isomères

Discrimination électrique directe des isomères conformationnels cis/trans liés à l’isomérisation des liaisons peptidiques impliquant la proline.

ConformationIsomères
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Figure 1 de l’article Nature Communications sur les conformations des peptides et protéines analysées par nanopore
Nature Communications2025

Nanopore Sensing of Protein and Peptide Conformation for Point-of-Care Applications

Une perspective sur le potentiel des nanopores pour analyser les conformations de peptides et de protéines en vue d’applications diagnostiques.

PerspectiveDiagnostic
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Couverture d’ACS Central Science consacrée à l’étude de 2024 sur les biomarqueurs par nanopore
ACS Central Science2024

Identification and Detection of a Peptide Biomarker and Its Enantiomer by Nanopore

Discrimination de l’énantiomère d’un biomarqueur peptidique à l’échelle de la molécule unique ; travaux présentés en couverture de la revue.

ChiralitéBiomarqueursAérolysine
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Figure 5 de l’article Communications Materials sur la discrimination des polysulfures à l’atome de soufre près
Communications Materials2020

Single-Sulfur Atom Discrimination of Polysulfides with a Protein Nanopore

Résolution à l’atome unique appliquée aux polysulfures impliqués dans la chimie des batteries lithium–soufre.

Détection à l’atome uniqueÉnergie
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AXES DE RECHERCHE

Des publications organisées autour de quatre questions scientifiques

01

Comment transformer les nanopores biologiques en lecteurs moléculaires ?

Modification de l’aérolysine, physique du transport et signatures électriques.

02

Comment utiliser les nanopores artificiels pour analyser des milieux complexes ?

Transport assisté par polymère, confinement et conditions robustes de détection.

03

Peut-on discriminer directement des biomarqueurs de maladies très proches ?

Variants peptidiques, conformères, stéréoisomères et modifications post-traductionnelles.

04

À quels autres domaines la détection par nanopore à l’échelle de la molécule unique peut-elle contribuer ?

Polymères numériques, chimie des batteries et nouveaux systèmes d’information moléculaire.

LISTE COMPLÈTE

Articles publiés dans des revues à comité de lecture

Google ScholarORCID

B. Cressiot est indiqué en gras dans chaque liste d’auteurs ; le soulignement de B. Cressiot indique qu’il est auteur correspondant ; les astérisques éventuels des autres auteurs sont conservés.

20264 publications (dont deux articles acceptés)
28

Direct identification and quantification of peptide biomarkers in 20% human serum using a solid-state nanopore platform and machine learning

Y. Cai, Y. Liu, I. Khaled, B. Cressiot, L. Bacri and J. Pelta

Journal of the American Chemical Society (JACS) · 2026 · Article accepté · DOI à venir

27

Phase and Conformational Transitions in Biomolecules and Polymers with Nanopores

Y. Cai, Y. Liu, L. Bacri, B. Cressiot and J. Pelta*

Small Methods · 2026 · Article accepté · DOI à venir

26

Identification and Discrimination of Sulfated and Unsulfated Gut-Hormone Biomarkers in Human Serum by Nanopore

L. Iesu, L. Bacri, J. Pelta* and B. Cressiot

Small · 2026 · DOI: 10.1002/smll.74968

25

Scaling laws in confined media applied for biomarker detection

Y. Cai, B. Cressiot, M. Winterhalter, S. Balme, J. Pelta and L. Bacri

Nature Communications · 2026 · DOI: 10.1038/s41467-026-68912-4

20254 publications
24

DNA aggregation and resolubilization in the presence of polyamines probed at the single molecule level using nanopores

Y. Cai, B. Cressiot, S. Balme, E. Raspaud, L. Bacri and J. Pelta

Chemical Science · 2025 · DOI: 10.1039/D5SC05267J

23

Discrimination of oxytocin, a behavioral neuropeptide hormone, and its structural variants by nanopore

N. Meyer, L. Ratinho, S. Greive, L. Bacri, B. Morozzo della Rocca, M. Chinappi, J. Pelta* and B. Cressiot

ACS Nano · 2025 · DOI: 10.1021/acsnano.5c08031

22

Single-molecule nanopore sensing of proline cis/trans amide isomers

L. Iesu, M. Sai, V. Torbeev, B. Kieffer, J. Pelta and B. Cressiot

Chemical Science · 2025 · DOI: 10.1039/D5SC01156F

21

Nanopore sensing of protein and peptide conformation for point-of-care applications

L. Ratinho, N. Meyer, S. Greive, B. Cressiot and J. Pelta*

Nature Communications · 2025 · DOI: 10.1038/s41467-025-58509-8

20241 publication
20

Identification and Detection of a Peptide Biomarker and Its Enantiomer by Nanopore

L. Ratinho, L. Bacri, B. Thiebot, B. Cressiot and J. Pelta

ACS Central Science · 2024 · DOI: 10.1021/acscentsci.4c00020

20233 publications
19

Identification of Conformational Variants for Bradykinin Biomarker Peptides from a Biofluid Using a Nanopore and Machine Learning

S. Greive, L. Bacri, B. Cressiot and J. Pelta*

ACS Nano · 2023 · DOI: 10.1021/acsnano.3c08433

18

Nanopore discrimination of coagulation biomarker derivatives and characterization of a post-translational modification

A. Stierlen, S. Greive, L. Bacri, P. Manivet, B. Cressiot and J. Pelta*

ACS Central Science · 2023 · DOI: 10.1021/acscentsci.2c01256

17

Circulating Tumor Cells in Cancer Diagnostics and Prognostics by Single-Molecule and Single-Cell Characterization

T. Chowdhury, B. Cressiot, C. Parisi, G. Smolyakov, B. Thiebot, L. Trichet, F. M. Fernandes, J. Pelta and P. Manivet

ACS Sensors · 2023 · DOI: 10.1021/acssensors.2c02308

20223 publications
16

Dynamics of DNA Through Solid-State Nanopores Fabricated by Controlled Dielectric Breakdown

I. Tanimoto, J. Zhang, B. Cressiot, B. Le Pioufle, L. Bacri and J. Pelta

Chemistry – An Asian Journal · 2022 · DOI: 10.1002/asia.202200888

15

Focus on using nanopore technology for societal health, environmental, and energy challenges

I. Tanimoto, B. Cressiot, S. Greive, B. Le Pioufle, L. Bacri and J. Pelta

Nano Research · 2022 · DOI: 10.1007/s12274-022-4379-2

14

Fast Decoding of the First Steps of Protein Aggregation Using a Nanopipette

B. Cressiot and J. Pelta

ACS Central Science · 2022 · DOI: 10.1021/acscentsci.2c00267

20211 publication
13

Selective target protein detection using a decorated nanopore into a microfluidic device

I. Tanimoto, B. Cressiot, N. Jarroux, J. Roman, G. Patriarche, B. Le Pioufle, J. Pelta and L. Bacri

Biosensors and Bioelectronics · 2021 · DOI: 10.1016/j.bios.2021.113195

20202 publications
12

The promise of nanopore technology: Advances in the discrimination of protein sequences and chemical modifications

B. Cressiot, L. Bacri and J. Pelta

Small Methods · 2020 · DOI: 10.1002/smtd.202000090

11

Single-sulfur atom discrimination of polysulfides with a protein nanopore for improved batteries

F. Bétermier, B. Cressiot, G. Di Muccio, N. Jarroux, L. Bacri, B. Morozzo della Rocca, M. Chinappi, J. Pelta and J.-M. Tarascon

Communications Materials · 2020 · DOI: 10.1038/s43246-020-00056-4

20191 publication
10

Aerolysin, a powerful protein sensor for fundamental studies and development of upcoming applications

B. Cressiot, H. Ouldali, M. Pastoriza-Gallego, L. Bacri, G. van der Goot and J. Pelta

ACS Sensors · 2019 · DOI: 10.1021/acssensors.8b01636

20182 publications
9

Thermostable virus portal proteins as reprogrammable adapters for solid-state nanopore sensors

B. Cressiot, S. Greive, M. Mojtabavi, A. Antson and M. Wanunu

Nature Communications · 2018 · DOI: 10.1038/s41467-018-07116-x

8

Differential enzyme flexibility probed using solid-state nanopores

R. Hu, J. Rodrigues, P. Waduge, H. Yamazaki, B. Cressiot, Y. Chishti, L. Makowski, D. Yu, E. Shakhnovich, Q. Zhao and M. Wanunu

ACS Nano · 2018 · DOI: 10.1021/acsnano.8b00734

20172 publications
7

Porphyrin-assisted docking of a thermophage portal protein into lipid bilayers: nanopore engineering and characterization

B. Cressiot, S. Greive, W. Si, T. Pascoa, M. Mojtabavi, M. Chechik, H. Jenkins, X. Lu, K. Zhang, A. Aksimentiev, A. Antson and M. Wanunu

ACS Nano · 2017 · DOI: 10.1021/acsnano.7b06980

6

Nanopore-based measurements of protein size, fluctuations, and conformational changes

P. Waduge, R. Hu, P. Bandarkar, H. Yamazaki, B. Cressiot, Q. Zhao, P. Whitford and M. Wanunu

ACS Nano · 2017 · DOI: 10.1021/acsnano.7b01212

20151 publication
5

Dynamics and energy contributions for transport of unfolded pertactin through a protein nanopore

B. Cressiot, E. Braselmann, A. Oukhaled, A. Elcock, J. Pelta and P. L. Clark

ACS Nano · 2015 · DOI: 10.1021/acsnano.5b03053

20141 publication
4

Focus on protein unfolding through nanopores

B. Cressiot, A. Oukhaled, L. Bacri and J. Pelta

BioNanoScience · 2014 · DOI: 10.1007/s12668-014-0128-7

20122 publications
3

Protein transport through a narrow solid-state nanopore at high voltage: experiments and theory

B. Cressiot, A. Oukhaled, G. Patriarche, M. Pastoriza-Gallego, J.-M. Betton, L. Auvray, M. Muthukumar, L. Bacri and J. Pelta

ACS Nano · 2012 · DOI: 10.1021/nn301672g

2

Wild-type, mutant protein unfolding and phase transition detected by single-nanopore recording

C. Merstorf, B. Cressiot, M. Pastoriza-Gallego, A. Oukhaled, J.-M. Betton, L. Auvray and J. Pelta

ACS Chemical Biology · 2012 · DOI: 10.1021/cb2004737

20111 publication
1

Dynamics of completely unfolded and native proteins through solid-state nanopores as a function of electric driving force

A. Oukhaled, B. Cressiot, L. Bacri, M. Pastoriza-Gallego, J.-M. Betton, E. Bourhis, R. Jede, J. Gierak, L. Auvray and J. Pelta

ACS Nano · 2011 · DOI: 10.1021/nn1034795

CHAPITRE D’OUVRAGE ## Méthodologies fondées sur les nanopores
2012

DNA unzipping and protein unfolding using nanopores

C. Merstorf, B. Cressiot, M. Pastoriza-Gallego, A. Oukhaled, L. Bacri, J. Gierak, J. Pelta, L. Auvray and J. Mathé

Nanopore-Based Technology · Methods in Molecular Biology, vol. 870 · Humana Press · DOI: 10.1007/978-1-61779-773-6_4