PROGRAMME DE RECHERCHE
Mes recherches dĂ©veloppent les nanopores biologiques et artificiels comme des outils dâanalyse Ă©lectrique des protĂ©ines, peptides, biomarqueurs de maladies et polymĂšres dĂ©finis en sĂ©quence.
Relier lâarchitecture du pore, le transport molĂ©culaire et les signatures quantitatives de courant ionique.
Une expĂ©rience de nanopore ne se limite pas Ă un Ă©vĂ©nement de dĂ©tection. Lâamplitude, la durĂ©e, les fluctuations et la distribution des signaux Ă©lectriques renseignent sur la charge, la forme, la conformation, la dynamique molĂ©culaire et les interactions avec le pore. Mon programme de recherche vise Ă relier ces observables Ă des propriĂ©tĂ©s chimiques et structurales prĂ©cises.
LâaĂ©rolysine est modifiĂ©e pour devenir un lecteur Ă©lectrique extrĂȘmement sensible des protĂ©ines et des peptides. Lâarchitecture du pore, ses charges internes et les conditions Ă©lectrolytiques sont modulĂ©es afin de contrĂŽler la capture, le transport et la rĂ©solution du signal.
Les nanopores artificiels constituent des plateformes robustes pour Ă©tudier le transport molĂ©culaire en milieu confinĂ© et dĂ©tecter des biomarqueurs dans des milieux complexes. Le contrĂŽle de lâenvironnement polymĂ©rique et lâanalyse des donnĂ©es permettent dâĂ©tendre la dĂ©tection Ă des Ă©chantillons contenant du sĂ©rum.
Les signatures nanopores permettent de distinguer des biomarqueurs trÚs proches par leurs résidus terminaux, leur stéréochimie, leur conformation ou leurs modifications post-traductionnelles, y compris dans des matrices biologiques complexes.
La dĂ©tection par nanopore est Ă©tendue au-delĂ des biomolĂ©cules conventionnelles vers les polymĂšres numĂ©riques dĂ©finis en sĂ©quence et les polysulfures rĂ©actifs impliquĂ©s dans la chimie des batteries lithiumâsoufre.
Pore, membrane, électrolyte, voltage et conditions moléculaires.
Capture, orientation, translocation, confinement et interactions.
Amplitude de blocage, temps de rĂ©sidence, fluctuations et populations dâĂ©vĂ©nements.
Variants chimiques, conformÚres, biomarqueurs et séquences encodées.
Ătablir les bases mĂ©canistiques du transport confinĂ© des protĂ©ines et de leur dĂ©tection par nanopore.
Des protéines de portail viral thermostables utilisées comme éléments de détection programmables.
Discrimination par nanopore dâun biomarqueur peptidique et de son Ă©nantiomĂšre.
Identification Ă©lectrique de variants peptidiques subtils, notamment les isomĂšres cis/trans de la proline.
DĂ©velopper la dĂ©tection de biomarqueurs dans des matrices rĂ©alistes et lire lâinformation encodĂ©e dans des polymĂšres synthĂ©tiques.
Acquisition de courants ioniques à faible bruit et analyse événement par événement.
Détection par aérolysine, contrÎle du transport et modification du pore.
Transport en milieu confiné et dans des échantillons complexes.
Protéines, peptides, isomÚres et modifications post-traductionnelles.
Signatures multidimensionnelles, classification et apprentissage automatique.
Relier chimie, conformation et lecture par nanopore.
Les collaborations sont particuliĂšrement pertinentes en chimie des peptides et des protĂ©ines, analyse de biomarqueurs, polymĂšres dĂ©finis en sĂ©quence, modĂ©lisation molĂ©culaire et matĂ©riaux pour lâĂ©nergie.
Nos recherches sur les polymĂšres numĂ©riques dĂ©finis en sĂ©quence visent Ă Ă©tablir les bases physiques de la lecture de lâinformation molĂ©culaire Ă lâĂ©chelle de la molĂ©cule unique. Lâobjectif est de contrĂŽler la capture et la translocation, dâamĂ©liorer la rĂ©solution des signaux de courant ionique et de modifier des nanopores biologiques complĂ©mentaires, afin de passer progressivement de la discrimination de sĂ©quences connues au dĂ©codage dâune information molĂ©culaire inconnue. Cet axe est scientifiquement distinct de la dĂ©tection de biomarqueurs et complĂšte nos travaux collaboratifs sur le stockage molĂ©culaire de lâinformation.
